Les Missions
Dans le cadre du projet SuPrTrYp (PEPR BBEST), il s’agira de développer, mettre en place et comparer des outils de prédiction automatique des fonctions enzymatiques de gènes de levures par apprentissage profond, notamment pour les gènes impliqués dans les voies métaboliques du tryptophane.
L'Activité
- Déploiement des différents outils existants de prédiction de fonctions enzymatiques pour leur application à l’annotation de gènes de levures
- Développement, entraînement et déploiement d’un nouvel outil dans la continuité du prototype EnzBERT développé par notre équipe
- Évaluation et comparaison des performances des différents outils de prédiction
- Spécialisation des meilleurs outils pour la prédiction de gènes d’intérêt impliqués dans les voies métaboliques du tryptophane
Compétences
- Expérience significative en apprentissage profond pour la classification de séquences à l’aide de modèles de langage
- Expérience significative dans le développement et l’entraînement d’outils de prédiction de fonctions protéiques
- Des connaissances en fonctions enzymatiques constitueraient un atout, sans être requises.
L'IRISA est aujourd'hui l'un des plus grands laboratoires de recherche français (plus de 850 personnes) dans le domaine de l'informatique et des technologies de l'information. Structuré en sept départements scientifiques, l'IRISA est un laboratoire d'excellence dont les priorités scientifiques sont la bioinformatique, la sécurité des systèmes, les nouvelles architectures logicielles, la réalité virtuelle, l'analyse des big data et l'intelligence artificielle. Tourné vers l'avenir de l'informatique et nécessairement tourné vers l'international, l'IRISA est au cœur même de la transition numérique de la société et de l'innovation au service de la cybersécurité, de la santé, de l'environnement et de l'écologie, des transports, de la robotique, de l'énergie, de la culture et de l'intelligence artificielle.
Présentation du CNRS en tant qu'employeur : https://www.cnrs.fr/fr/le-cnrs
Présentation de l'IRISA comme laboratoire d'affectation : https://www.irisa.fr/umr-6074
Entre 2496.98 € et 2879.38 € brut
44 jours
Pratique et indemnisation du TT
Prise en charge à 75% du coût et forfait mobilité durable jusqu’à 300€
Référence de l’offre
UMR6074-FRACOS-001
Secteur d’activité
Sciences du vivant, de la terre et de l'environnement
Emploi type
Ingenieur biologiste en analyse de donnees (H/F)
Le CNRS est un acteur majeur de la recherche fondamentale à une échelle mondiale. Le CNRS est le seul organisme français actif dans tous les domaines scientifiques. Sa position unique de multi-spécialiste lui permet d’associer les différentes disciplines pour affronter les défis les plus importants du monde contemporain, en lien avec les acteurs du changement.
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