Mycobacterium abscessus est un pathogène émergent causant de graves infections pulmonaires, en particulier chez les patients atteints de mucoviscidose. Cette bactérie est difficile à éliminer en raison de son extrême résistance aux antibiotiques ; les traitements actuels durent jusqu'à deux ans et présentent un faible taux de réussite. Chez l'hôte, elle évolue dans divers environnements, tels que des biofilms à la surface de l'épithélium pulmonaire ou dans des macrophages, et adapte son métabolisme en conséquence. Cela conduit à des bactéries présentant une tolérance phénotypique aux antibiotiques (une capacité accrue à survivre au traitement sans être résistante), et augmente le risque de rechute ou d’émergence de résistance. Les objectifs de notre équipe sont d’identifier et de caractériser les fonctions bactériennes qui permettent aux mycobactéries pathogènes de survivre pour de longues périodes chez l’hôte, de se transmettre, et de résister aux antibiotiques.
Sous la direction du chef d’équipe, la personne recrutée contribuera à la réalisation d’un projet de recherche visant à étudier le rôle de la signalisation par l'adénosine monophosphate cyclique (AMPc) chez M. abscessus dans l'adaptation de cette bactérie à l'hôte et aux antibiotiques. Elle aura en charge l’ingénierie génétique de bactéries de différentes espèces et de différentes classes de risque (1 à 2), et la réalisation d’expériences de microbiologie et de biologie moléculaire.
- Mettre en œuvre des approches d’ingénierie génétique pour produire des souches recombinantes de différentes espèces de mycobactérie (dont des pathogènes de classe 2)
- Réaliser des expériences de microbiologie (culture et suivie de croissance, évaluation de résistance aux antibiotiques…)
- Utiliser des approches de biologie moléculaire de l’ADN et des protéines (PCR, RT-qPCR, construction de plasmides, Western-blot, …)
- Utiliser des tests biochimiques pour mesurer certains paramètres physiologiques (mesure de l’ATP, de la balance redox ou des radicaux oxygénés)
- Préparer des échantillons pour des analyses omiques (RNAseq, Métabolites,…) sur différentes plateformes technologiques
- Analyser, interpréter et présenter les résultats d’expériences
- Rédiger des rapports d'expériences et un cahier de laboratoire
- Participer aux réunions de laboratoire et de consortium et présenter les résultats
- Réaliser une veille scientifique et technologique relative au projet scientifique
- Participer aux taches collectives (préparation de milieux, entretien des équipements…)
- Connaissances approfondies en microbiologie et biologie moléculaire des bactéries.
- Maitrise des outils de bureautique et de logiciels spécialisés (Clone Manager et Prism, par exemple)
- Notion de base en bioinformatique et analyse des bases de données
- Rigueur expérimentale, sens de l'organisation
- Connaissance des bonnes pratiques de laboratoire.
- Avoir un raisonnement analytique et faire preuve de créativité.
- Capacité à travailler en équipe et autonomie
- Maitrise de l'anglais scientifique : B1 à B2 (selon le cadre européen commun de référence pour les langues). Connaissance de la langue anglaise permettant d'avoir une conversation par écrit ou par oral.
Le travail sera réalisé à l'IPBS, un laboratoire du CNRS de 250 personnes localisé au 205 route de Narbonne à Toulouse. Le laboratoire travaille sur des problématiques d'infection, inflammation et cancer. L'équipe d'accueil développe des projets sur les interactions hôte-pathogènes et est composée d'une dizaine de membres incluant 4 statutaires et des post-doctorants, doctorants, étudiants de Master en CDD.
L'ingénieur(e) travaillera directement sous la responsabilité du chef d’équipe et en collaboration avec une Ingénieure d’Etude statutaire.
La manipulation de certaines espèces mycobactériennes, comme Mycobacterium abscessus, exige un travail en laboratoires confinés de niveau de sécurité 2.
entre 2496 et 2662 euros bruts mensuels selon expérience
44 jours
Pratique et indemnisation du TT
Prise en charge à 75% du coût et forfait mobilité durable jusqu’à 300€
Référence de l’offre
UMR5089-CHRGUI-009
Secteur d’activité
Sciences du vivant, de la terre et de l'environnement
Emploi type
Ingenieur biologiste en laboratoire (H/F)
Expérience souhaitée
1 à 4 années
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