PathoQuest, a Charles River company, est une société spécialisée de prestation de service (CRO). Elle développe et met en œuvre des solutions de contrôle qualité appliquées aux produits pharmaceutiques d’origine biologique. Ses analyses s’appuient sur le séquençage haut débit, des pipelines bio-informatiques spécialisés, des bases de données de référence et des outils logiciels utilisés dans un environnement réglementé GMP.
Afin d'accompagner l'évolution de ses plateformes de traitement de données, PathoQuest poursuit la structuration et l'industrialisation de son infrastructure informatique. Les équipes techniques développent et maintiennent des solutions permettant d'automatiser les déploiements, de standardiser les infrastructures, d'orchestrer les flux de données et d'assurer la traçabilité des traitements, aussi bien sur des infrastructures cloud que sur des systèmes on-premise.
Dans un contexte de croissance et d'amélioration continue des processus, nous recherchons un(e) alternant(e) pour participer à l'évolution de cette plateforme technique. L'objectif est de développer des outils robustes et reproductibles facilitant le travail des équipes scientifiques et opérationnelles tout en répondant aux exigences d'un environnement réglementé GMP.
Sujet de l'alternance
L'alternant(e) intégrera l'équipe en charge des infrastructures et de l'automatisation des traitements. Il ou elle participera à l'évolution d'une plateforme technique utilisée quotidiennement pour le déploiement des applications, le traitement des données scientifiques et l'exploitation des différents environnements de l'entreprise.
Les travaux confiés auront pour objectif de rendre les infrastructures plus automatisées, plus homogènes et plus simples à maintenir. L'alternant(e) contribuera également à améliorer la reproductibilité des déploiements, la traçabilité des opérations et la qualité de la documentation technique.
Les missions pourront notamment porter sur :
- Participer au développement et à l'évolution de l'infrastructure AWS.
- Développer et maintenir les déploiements en Infrastructure as Code avec Terraform.
- Maintenir, faire évoluer et documenter les playbooks Ansible utilisés sur les infrastructures cloud et on-premise.
- Développer des outils et scripts d'automatisation en Python et Bash.
- Participer à l'amélioration des pipelines GitLab CI/CD.
- Contribuer à l'encapsulation des applications à l'aide de Docker.
- Participer à l'automatisation et à l'industrialisation des workflows de traitement de données.
- Contribuer à la standardisation des échanges entre applications et des processus techniques.
- Participer à l'amélioration de la supervision, de la traçabilité et de la reproductibilité des traitements.
- Rédiger et maintenir la documentation technique associée aux développements réalisés.
- Participer à l'amélioration continue des processus dans le respect des exigences GMP.
Selon les projets, les technologies utilisées pourront inclure :
- Python
- Bash
- Linux
- Git et GitLab CI/CD
- AWS (EC2, S3, ECS, IAM, CloudWatch...)
- Terraform
- Ansible
- Docker
- Snakemake
- JSON, YAML
Formation en préparation et compétences recherchées
Étudiant(e) titulaire d'un Bac+3 souhaitant préparer un Master en informatique, cloud computing, systèmes et réseaux, génie logiciel, DevOps ou formation équivalente.
Vous appréciez le développement logiciel, l'automatisation, les infrastructures cloud et les problématiques liées à la qualité des systèmes informatiques.
Une première expérience sur plusieurs des technologies suivantes sera appréciée :
- Python
- Linux
- Git
- Docker
- AWS ou un autre fournisseur cloud
- Terraform et/ou Ansible
Vous êtes curieux(se), aimez comprendre le fonctionnement d'un système dans son ensemble et souhaitez contribuer à la conception d'une plateforme technique utilisée en production.
Les projets étant réalisés au sein d'une entreprise de biotechnologie, un intérêt pour les sciences du vivant constitue un atout, mais aucune connaissance préalable en bio-informatique n'est requise.
Qualités attendues
Étudiant(e) motivé(e), impliqué(e), curieux(se), rigoureux(se) et autonome, vous appréciez résoudre des problématiques techniques et développer des solutions fiables et maintenables.
Vous êtes organisé(e), aimez documenter votre travail et êtes sensible aux notions de qualité, de reproductibilité et de traçabilité.
Vous êtes capable de travailler en équipe dans un environnement international tout en vous adaptant aux contraintes d'un contexte réglementé GMP.
Ce que vous apprendrez
Cette alternance vous permettra de participer à la conception et à l'évolution d'une plateforme technique utilisée en production pour le traitement de données scientifiques.
Vous développerez des compétences en cloud AWS, Infrastructure as Code (Terraform et Ansible), développement Python, automatisation des déploiements, GitLab CI/CD, Docker, orchestration de workflows et industrialisation des infrastructures.
Vous découvrirez également les exigences spécifiques des environnements réglementés GMP, notamment en matière de qualification des systèmes, de traçabilité, de reproductibilité et de gestion documentaire.
Au cours de votre alternance, vous contribuerez directement à des projets ayant un impact concret sur les équipes scientifiques, bio-informatiques et opérationnelles de l'entreprise.
Un niveau d'anglais intermédiaire est requis afin de pouvoir échanger avec les collègues basés aux États-Unis.
Nature du contrat : Alternance de 2 ans.
Candidature : Envoyez votre candidature à : [email protected]
Avantages :
- Flextime
- Restaurant d'entreprise
- RTT
Lieu du poste : Télétravail hybride (75013 Paris)
