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INRAE, Institut national de recherche pour l’agriculture, l’alimentation et l’environnement, est un organisme public de recherche qui réunit 12 000 collaborateurs au sein de 272 unités réparties sur 18 centres en France. Premier organisme mondial spécialisé sur l’ensemble agriculture – alimentation – environnement, INRAE joue un rôle clé pour accompagner les transitions nécessaires face aux grands défis planétaires.
Face à l’augmentation de la population, aux enjeux de sécurité alimentaire, au changement climatique, à la raréfaction des ressources et au déclin de la biodiversité, INRAE s’engage à développer des solutions scientifiques et à accompagner l’évolution des pratiques agricoles, alimentaires et environnementales
Vous exercerez votre activité au sein de l'UMR 1131 « Santé de la vigne et qualité du vin » (SVQV), qui a pour mission de développer des recherches et des expérimentations pour répondre aux enjeux d'une viticulture qualitative, à bas intrants et résiliente face au changement climatique. L'UMR SVQV conduit des recherches visant à identifier chez la vigne les déterminants génétiques des caractères d'intérêt agronomique liés à la résistance de la vigne à ses principaux pathogènes fongiques et à l'adaptation au changement climatique. Ces connaissances sont ensuite intégrées dans des programmes d'innovation variétale pour la création de nouvelles variétés résistantes, qualitatives et adaptées à l'évolution du climat. L'unité a ainsi inscrit 12 variétés de vigne au catalogue officiel. L'unité dispose d'équipements modernes pour le phénotypage des résistances, les travaux de génétique/génomique, ainsi que pour la caractérisation approfondie du métabolisme spécialisé.
L'unité développe des recherches visant à identifier les facteurs génétiques impliqués dans des caractères d'intérêt agronomique, notamment la résistance aux maladies et l'adaptation de la vigne aux évolutions climatiques.
Votre mission s'inscrit au sein de l'équipe Génétique et amélioration de la vigne, qui conduit des programmes de recherche et d'amélioration variétale. Vous contribuerez à produire et valoriser des données génétiques et génomiques nécessaires à la sélection de nouvelles variétés de vigne combinant performances agronomiques, qualité des raisins et réduction des impacts environnementaux.
Ce poste joue un rôle clé dans l'intégration des approches de biologie moléculaire et de génomique au service de l'innovation variétale. Vous participerez à l'identification des relations entre les caractéristiques génétiques des plantes et leurs propriétés observées, afin d'accompagner la création de variétés mieux adaptées aux enjeux actuels de la viticulture.
Dans ce cadre, vous serez en charge des activités suivantes :
Génétique et génomique
- Choisir les méthodes de génotypage adaptées aux programmes de recherche et de sélection assistée par marqueurs.
- Produire des jeux de données génotypiques sur de grands effectifs à partir de différentes approches, notamment les marqueurs microsatellites et les technologies de séquençage haut débit.
- Centraliser les connaissances sur les relations entre patrimoines génétiques et caractères observés issues des travaux de l'unité, de la bibliographie et des collaborations.
- Mettre en œuvre des technologies permettant de caractériser l'expression des gènes, comme la qPCR ou le séquençage des ARN.
Analyse et valorisation des données
- Assurer la traçabilité, la sécurisation et l'organisation des données génétiques et transcriptomiques.
- Extraire des informations exploitables à partir de données brutes grâce à des outils de bio-informatique.
- Participer à l'analyse des relations génotype-phénotype en collaboration avec les chercheur-euse-s et les bio-informaticien-ne-s de l'unité.
- Contribuer à la valorisation des résultats sous différentes formes (rapports techniques, publications ou présentations).
Innovation et développement des méthodes
- Assurer une veille technologique dans les domaines de la biologie moléculaire, de la génomique et de l'analyse des données.
- Participer au déploiement de nouveaux outils et approches pour améliorer les programmes de sélection variétale.
Vous disposez d'une formation supérieure en génétique, biologie moléculaire, génomique ou dans un domaine scientifique proche.
Une expérience pratique en biologie moléculaire, génomique et analyse de données est souhaitée. Une première expérience de valorisation de résultats scientifiques sous forme de rapports techniques, publications ou présentations orales sera appréciée.
Savoir-faire :
- Maîtriser les bases théoriques et pratiques en biologie moléculaire, génétique et génomique.
- Utiliser des outils d'analyse de données et des approches de bio-informatique.
- Mettre en œuvre des techniques de caractérisation de l'expression des gènes.
- Analyser et interpréter des données issues de travaux de génotypage et de transcriptomique.
Savoir-être :
- Capacité à acquérir de nouvelles connaissances, notamment en génétique et en bio-informatique.
- Rigueur et sens de l'organisation.
- Goût pour le travail en équipe et les échanges interdisciplinaires.
- Curiosité scientifique et capacité à proposer des améliorations méthodologiques.
