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L’Institut national de recherche pour l’agriculture, l’alimentation et l’environnement (INRAE) est un établissement public de recherche rassemblant une communauté de travail de 12 000 personnes, avec 272 unités de recherche, de service et expérimentales, implantées dans 18 centres sur toute la France. INRAE se positionne parmi les tout premiers leaders mondiaux en sciences agricoles et alimentaires, en sciences du végétal et de l’animal. Ses recherches visent à construire des solutions pour des agricultures multi-performantes, une alimentation de qualité et une gestion durable des ressources et des écosystèmes.
Rejoignez l’équipe qui développe l’infrastructure ouverte et partagée pour l'interopérabilité sémantique en agriculture et alimentation.
L’INRAE recrute un·e ingénieur·e d’étude en développement full stack et intelligence artificielle pour contribuer à l’évolution des plateformes AgroPortal, EarthPortal et de l’écosystème OntoPortal.
Le poste vise à développer et intégrer de nouveaux composants IA (LLMs, RAG, GraphRAG, embeddings, agents, MCP, NLP) afin de créer une nouvelle génération de services intelligents autour des ontologies, graphes de connaissances et données FAIR.
Nous recherchons un profil informatique polyvalent, curieux et expérimentateur, capable de travailler à l’interface entre développement Web, IA générative et Web sémantique. Vous travaillerez au sein de l’équipe de recherche MISTEA à Montpellier.
Employeur : INRAE
Durée : CDD de 24 à 36 mois à partir de juin 2026
Lieu : Montpellier — Campus Institut Agro La Gaillarde (unité MISTEA)
Teletravail : Jusqu'à 3 jours par semaine
Type de poste : Ingénieur d’étude en CDD (REFERENS E2C45)
Rémunération : 2200€ à 3200€ brut/mois selon expérience
Avantages : 30 jours de congés + 15 jours de RTT/an, horaires flexibles, environnement international et open source, perspectives de prolongation possibles
Profil : Bac+5 (Master ou école d’ingénieur) en informatique ou science des données / IA
Experience: 0 a 3 ans d'expérience; diplôme niveau Master ou Ingénieur en Informatique
Les ontologies, vocabulaires et terminologies sont aujourd’hui essentiels pour rendre les données scientifiques interopérables et réutilisables selon les principes FAIR.
AgroPortal (https://agroportal.eu) est une plateforme de référence pour l’hébergement, la recherche, la visualisation et l’exploitation d’artefacts sémantiques dans les domaines de l’agriculture, de l’alimentation et de l’environnement. La plateforme héberge aujourd’hui plusieurs centaines de ressources utilisées par des communautés scientifiques et techniques internationales.
Le projet s’inscrit dans l’écosystème open source OntoPortal (https://ontoportal.org), une initiative internationale réunissant plusieurs institutions académiques et infrastructures de recherche qui mutualisent leurs développements autour d’une technologie commune de catalogues d’artéfacts sémantiques.
Les plateformes OntoPortal hébergent une grande quantité de connaissances structurées (ontologies, vocabulaires, alignements, annotations, projets, agents, notes, etc.) qui restent souvent difficiles à exploiter directement pour les utilisateurs non spécialistes du Web sémantique. L’objectif du poste est de faire émerger une nouvelle couche de services intelligents au-dessus des plateformes existantes. Les avancées récentes en IA générative ouvrent de nouvelles possibilités :
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l’interrogation des plateformes en langage naturel (assistants IA, chatbots)
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l’exploration conversationnelle des ontologies,
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la recommendation d’ontologies et de termes,
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la génération de requêtes SPARQL,
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l’annotation de données textuelles et extraction terminologique,
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l’alignement d’ontologies,
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l’enrichissement automatique des ontologies, génération de connaissances,
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l’exploitation des APIs OntoPortal (MCP) par des agents IA.
Vous contribuerez directement à une infrastructure utilisée dans des projets européens et internationaux autour des données scientifiques, de l’IA et du Web sémantique.
Référentiels techniques :
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GitHub AgroPortal: https://github.com/agroportal
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GitHub OntoPortal: https://github.com/ontoportal
Au sein d’une petite équipe technique et scientifique (3–4 personnes), vous participerez activement au développement et à l’évolution d’AgroPortal et OntoPortal avec un focus sur les questions d’IA. Vos missions incluront notamment :
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Concevoir des architectures RAG et GraphRAG adaptées aux graphes de connaissances RDF et aux ontologies
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Développer des assistants conversationnels exploitant les APIs OntoPortal
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Expérimenter embeddings, vector search et retrieval hybride
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Concevoir des workflows agents / MCP / LLMs
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Développer des services IA autour de l’annotation sémantique, l’alignement d’ontologies, la génération SPARQL, l’extraction terminologique, l’aide à la curation et l’enrichissement d’ontologies, etc.
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Intégrer des composants IA dans les plateformes existantes
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Concevoir widgets et assistants intégrés aux portails
Plusieurs prototypes existent déjà dans l’écosystème OntoPortal, notamment : ontoportal-mcp, ontoportal-rag, ainsi que différentes expérimentations autour de Dify, LangChain, GraphRAG, annotation assistée par LLMs et génération de mappings d’ontologies. Des travaux de recherche sont en cours également sur la représentation sémantique des "variables scientifiques" (représentation formelle et non ambiguë permettant la standardisation, l'interopérabilité, et la réutilisabilité des données scientifiques ainsi que l’automatisation de leur traitement/exploitation) et leur exploitation avec des approches d’IA hybride.
Le poste consiste précisément à transformer ces prototypes et explorations en composants plus robustes, intégrés et réutilisables dans les plateformes.
Plus généralement vos missions incluront également:
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Collaborer avec des partenaires scientifiques et techniques internationaux
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Contribuer aux développements open source d’OntoPortal
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Participer aux choix techniques et à l’évolution de l’architecture logicielle
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Encadrer ponctuellement des stagiaires ou étudiants
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Ruby / Ruby on Rails
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Hotwire
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HTML / CSS / SCSS / Bootstrap
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JavaScript (Stimulus, jQuery)
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Sidekiq
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Redis
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RDF
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SPARQL
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OWL / SKOS
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Triple stores / bases de graphes
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Python
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LLMs
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RAG / GraphRAG
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Embeddings
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Transformers (Hugging Face)
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LangChain / LlamaIndex / Haystack
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MCP (Model Context Protocol)
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Docker
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GitHub
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CI/CD
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APIs REST
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Développement open source collaboratif
Nous recherchons un profil fullstack polyvalent, doté d'une forte sensibilité et expérience en IA. Diplômé niveau bac+5 en informatique (master ou ingénieur) formé en sciences des données ou IA. Idéalement, un cours sur le web sémantique aura été suivi dans la formation. L’expertise en agriculture / alimentation n’est pas vraiment nécessaire mais bien évidemment une sensibilité et culture de ces disciplines sera appréciée. Nous recherchons avant tout une personne curieuse, autonome et motivée par les projets à impact scientifique et open source.
Vous avez idéalement :
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une première expérience en développement Web full stack
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une bonne maîtrise d’un framework MVC moderne (Ruby on Rails idéalement)
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une très bonne maîtrise de Python et des framework IA
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une sensibilité pour les données, les APIs et les architectures Web
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une pratique des outils collaboratifs de développement (GitHub, issues, PR, CI/CD)
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une capacité à à expérimenter rapidement et prototyper
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une très bonne maîtrise du français à l'oral et à l'écrit et des fortes aptitudes à lire/écrire en anglais
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une capacité à être autonome et à prendre des initiatives
Des connaissances dans les domaines suivants seraient un plus :
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Web sémantique et ontologies
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gestion de données scientifiques
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technologies RDF / SPARQL / graphes
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experience en NLP
Voyages nationaux et internationaux (Europe) acceptés.
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Travailler sur une plateforme open source reconnue internationalement
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Contribuer à des projets scientifiques européens de premier plan
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Développer des outils utilisés par des chercheurs, ingénieurs et infrastructures de données
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Avoir une forte liberté technique et technologique
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Évoluer dans une équipe à taille humaine avec une forte autonomie
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Participer à l’écosystème FAIR, IA & Web sémantique
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Collaborer avec des partenaires européens et internationaux
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Vivre et travailler à Montpellier, un des pôles français du numérique et de la recherche agronomique
En rejoignant INRAE, vous bénéficiez (selon le type de contrat et sa durée) :
- jusqu'à 30 jours de congés + 15 RTT par an (pour un temps plein)
- d'un soutien à la parentalité : CESU garde d'enfants, prestations pour les loisirs ;
- de dispositifs de développement des compétences : formation, conseil en orientation professionnelle ;
- d'un accompagnement social : conseil et écoute, aides et prêts sociaux ;
- de prestations vacances et loisirs : chèque-vacances, hébergements à tarif préférentiel ;
- d'activités sportives et culturelles ;
- d'une restauration collective.
