Missions
Les histones sont des composants régulateurs importants de la chromatine eucaryote et il a été démontré que les formes variantes des protéines histones jouent des rôles cruciaux dans divers processus biologiques chez les animaux et les plantes terrestres. Faisant suite à l’identification récente de trois nouveaux variants d’histones algales de la protéine H2A, le projet ANR His2AVar vise à investiguer les rôles fonctionnels de ces nouveaux variants chez les Stramenopiles, avec un accent particulier sur les algues brunes dans le laboratoire qui accueille ce poste de technicien supérieur.
Le candidate utilisera la méthodologie CRISPR développée dans le laboratoire hôte pour muter les loci codant l’histone H2A dans l’organisme modèle d’algue brune Ectocarpus. Les phénotypes des mutants résultants seront ensuite analysés aux niveaux morphologique et moléculaire, ce dernier impliquant à la fois une analyse transcriptomique et une analyse de la chromatine en utilisant la méthode de ChIP-seq.
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Senior technician in brown algal molecular genetics
Histones are important regulatory components of eukaryotic chromatin and variant forms of histone proteins have been shown to play crucial roles in diverse biological processes in both animals and land plants. Following up on the recent identification of three novel algal variants of the histone H2A protein, the ANR project His2AVar aims to investigate the functional roles of these novel variants in Stramenopiles, with a particular focus on brown algae in the laboratory that is hosting this senior technician post.
The candidate will use CRISPR methodology developed in the host laboratory to delete histone H2A loci in the brown algal model organism Ectocarpus. The phenotypes of the resulting mutants will then be analysed at both the morphological and molecular levels, the latter involving both transcriptomic analysis and chromatin analysis using ChIP-seq.
Activités
Le projet impliquera le maintien et la croissance de souches d'Ectocarpus de type sauvage et mutantes, l'application de la méthodologie CRISPR-Cas9 pour générer de nouvelles lignées mutantes et la caractérisation phénotypique de ces lignées mutantes. Le phénotypage utilisera une gamme d'approches différentes, y compris la morphométrie, les approches de biologie cellulaire, et des approches transcriptomiques et épigénétiques. Des protocoles sont disponibles dans le laboratoire d'accueil pour toutes ces approches.
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The project will involve maintenance and growth of wild type and mutant Ectocarpus strains, application of CRISPR methodology to generate new mutant lines and phenotypic characterisation of newly created mutant lines. Phenotyping will employ a range of different approaches including morphometry, cell biology approaches, transcriptomic and epigenetic approaches. Protocols are available in the host laboratory for all these approaches.
Compétences attendues
Le candidat(e) doit maitriser des approches standard de biologie moléculaire et de biologie cellulaire (microscopie) et une connaissance des techniques de CRISPR et/ou le culture des algues brunes. Des compétences bio-informatiques, par exemple la capacité d’analyser des données transcriptomiques, serait également appréciée.
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The candidate should have experience with standard molecular biology and cell biology (microscopy) approaches and experience working with CRISPR methodology and/or handling brown algae in culture. Standard bioinformatic skills, for example the capacity to handle transcriptomic data, would also be appreciated.
Contexte de travail
L'institut d'accueil : La Station Biologique de Roscoff (SBR) est un centre de recherche en biologie marine et océanologie (http://www.sb-roscoff.fr/about-roscoff-marine-station/missions.html). Il est situé dans la ville de Roscoff sur la côte nord de la Bretagne, à environ 60 km à l’est de Brest. Le personnel du SBR comprend environ 200 employés permanents.
Le poste est financé par l'Agence nationale de la recherche, projet His2AVar. Il inclura des interactions fortes avec le laboratoire US2B (UMR6286) à Nantes et l'iGReD (UMR6293) à Clermont-Ferrand.
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The host institute, the Station Biologique de Roscoff (SBR, http://www.sb-roscoff.fr/about-roscoff-marine-station/missions.html), is a centre of marine biology and oceanographic research situated in the town of Roscoff on the north coast of Brittany (France) about 60 km east of Brest. The SBR has about 200 permanent employees.
The postdoctoral fellowship is financed by the "Agence Nationale de la Recherche" (ANR) project His2AVar. The project will involve strong collaborative interactions with the Unit of Biologic Sciences and Biotechnologies (UMR6286) in Nantes and the Institute of Genetics, Reproduction and Development (UMR6293) in Clermont-Ferrand.
Job Types: Full-time, Temporary
Pay: 3,143.00€ - 3,645.00€ per month
Work Location: In person
