Sous la responsabilité conjointe du Dr. François Foulquier et du Dr. Ninon Very, vous participerez activement au développement de ce projet à travers les missions suivantes :
- Techniques de biologie cellulaire : assurer la culture, la conservation et l’entretien des lignées cellulaires (modèles knock-out) et des fibroblastes issus de patients CDG, réaliser des transfections (transitoires ou stables), ainsi que des analyses du glycoprotéome en microscopie confocale en fluorescence
- Techniques de biochimie fonctionnelle et structurale : analyser les glycanes et les glycoprotéines par des approches complémentaires de biochimie (Western-blot, lectin-blot, cytométrie en flux, RTqPCR), de glycomique classique (spectrométrie de masse) et de marquage métabolique à l’aide de précurseurs non naturels de sucres, couplé à des approches de chimie-click
- Approches thérapeutiques : contribuer à la mise au point d’une approche thérapeutique pour les CDG associés à des perturbations du transport de protons, notamment par supplémentation en manganèse
1. Biologie cellulaire (Env. 30% du temps)
- Gestion quotidienne des lignées cellulaires et des fibroblastes de patients : mise en culture, comptage, congélation et décongélation
- Préparation des milieux de culture et des réactifs nécessaires aux expériences, dans le respect des règles de stérilité et d’utilisation du PSM de type L2
- Ensemencement et traitement des cellules (traitements pharmacologiques, transfection de plasmides, précurseurs de sucres non naturels)
- Préparation des échantillons biologiques pour les différentes analyses expérimentales
2. Imagerie cellulaire et cytométrie en flux (Env. 20% du temps)
- Fixation et marquage des cellules à l’aide d’anticorps et de lectines pour les analyses en microscopie et en cytométrie en flux
- Acquisition et analyse informatique des images obtenues en microscopie confocale et en fluorescence, ainsi que des données issues de la cytométrie en flux via les logiciels dédiés
3. Biochimie et glycomique (Env. 20% du temps)
- Analyse des glycanes et glycoprotéines par Western-blot, lectinographie et analyse de l’expression génique par RT-qPCR
- Acquisition, traitement et analyse statistique des données expérimentales
- Préparation des échantillons destinés aux analyses de spectrométrie de masse et aux approches de marquage métabolique
4. Évaluation des approches thérapeutiques (Env. 15% du temps)
- Mise en œuvre des protocoles expérimentaux permettant d’évaluer l’effet de traitements sur les phénotypes cellulaires et les défauts de glycosylation
- Suivi et comparaison des résultats obtenus dans les différentes conditions expérimentales
- Contribution à l’optimisation des conditions de traitement à visée thérapeutique
5. Vie du laboratoire & Traçabilité (Env. 15% du temps)
- Planification et organisation des expériences selon les protocoles établis
- Traçabilité rigoureuse des échantillons, des expériences et des résultats sur le cahier de laboratoire (physique ou électronique)
- Participation à la gestion des stocks de consommables et réactifs liés à l’activité, et à l’entretien courant des équipements et des espaces de travail
- Application et respect strict des consignes d'hygiène et de sécurité (H&S) en environnement de type L2
- Participation au bon fonctionnement collectif de l’équipe et du laboratoire
Compétences techniques indispensables :
- Connaissances scientifiques générales : solides connaissances générales en biologie et maîtrise théorique et pratique des bases de biologie cellulaire et de biochimie. Des connaissances en glycobiologie constitueraient un réel atout
- Biologie cellulaire : maîtrise des principales techniques de biologie cellulaire, des règles d’asepsie et de travail sous PSM L2
- Biochimie : maîtrise des techniques de Western blot, de cytométrie en flux et de RT-qPCR. Une familiarité avec les approches d’analyse des glycoprotéines et des glycoconjugués (lectinographie, spectrométrie de masse, marquage métabolique) serait un plus
- Anglais scientifique : bonne maîtrise de l’anglais scientifique (lecture et rédaction de protocoles et documents scientifiques)
- Veille et restitution : capacité à rechercher, synthétiser l’information scientifique (veille de la littérature) et à restituer clairement ses résultats lors des réunions d’équipe
Qualités professionnelles :
- Rigueur et fiabilité : soin et précision dans l’exécution des protocoles expérimentaux, respect des procédures et fiabilité dans la réalisation et le suivi des expériences
- Curiosité scientifique : intérêt pour la compréhension des mécanismes biologiques et démarche proactive pour approfondir les connaissances nécessaires au projet
- Proactivité et esprit d'initiative : Force de proposition dans la planification, l’organisation et l'anticipation du calendrier expérimental, ainsi que dans la mise en œuvre de nouvelles approches ou expériences nécessaires à l’avancement du projet
- Autonomie et esprit d’équipe : capacité à mener ses tâches quotidiennes de manière autonome à la paillasse, tout en s’intégrant activement, de manière collaborative et constructive, au sein de l’équipe de recherche et du laboratoire
- Motivation et dynamisme : implication, assiduité et volonté de s’investir pleinement dans les différentes activités du projet
- Adaptabilité et créativité : capacité à s’adapter aux contraintes expérimentales, à proposer des solutions et à contribuer à l’optimisation et au développement de nouvelles approches expérimentales
Le poste proposé se situe au sein de l’Unité de Glycobiologie Structurale et Fonctionnelle (UGSF), dans l’équipe du Dr. François Foulquier. L’UGSF est un institut internationalement reconnu pour ses travaux sur les glycosciences et est composé de plusieurs équipes inter-disciplinaires. L’équipe du Dr. Foulquier se base sur l’utilisation de lignées cellulaires et cellules de patients développant des troubles congénitaux de la glycosylation (CDG) et, vise à combiner recherche fondamentale et recherche translationnelle dans le but de mieux comprendre les mécanismes de glycosylation et de développer des approches thérapeutiques novatrices afin d’améliorer la qualité de vie des patients.
Dans ce contexte, le poste s’inscrira dans l’axe de recherche développé au sein de l’équipe du Dr. Foulquier, consacré à l’étude intégrée des glycanes, de l’environnement cellulaire, du trafic golgien et du pH. Ce projet visera à caractériser le rôle joué par TMEM165 dans la régulation de l’homéostasie ionique Ca2+/Mn2+ et du pH golgien, notamment via ses potentielles interactions avec le complexe V-ATPase. A terme, l’objectif est d’identifier de nouvelles stratégies thérapeutiques pour les patients atteints de CDG associés à une perturbation du pH golgien, notamment en évaluant le potentiel d’une supplémentation en manganèse.
salaire mensuel brut entre 2521,15 euros et 2688,76 euros selon expérience
44 jours
Pratique et indemnisation du TT
Prise en charge à 75% du coût et forfait mobilité durable jusqu’à 300€
Référence de l’offre
UMR8576-MARRAT-063
Secteur d’activité
Sciences du vivant, de la terre et de l'environnement
Emploi type
Ingenieur en techniques biologiques (H/F)
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