Le Centre de Lutte contre le Cancer (CLCC) Jean PERRIN, basé à Clermont Ferrand, ville dynamique, attractive et universitaire de haut niveau, est l’un des 18 Centres de Lutte contre le Cancer en France (CLCC). Il exerce des missions de soins, d’enseignement et de recherche.
Le Laboratoire de Biologie Médicale (LBM), accrédité COFRAC depuis 2015, se compose de deux unités, Anatomie pathologie et Oncogénétique, et comprend une équipe de plus de 70 personnes dont 12 médecins (anatomopathologistes, biologistes et généticien), 6 ingénieurs et 2 bio informaticiens. Plus de 1300 NGS constitutionnels et plus de 3300 NGS tumoraux sont réalisés tous les ans.
Le LBM a également une activité de recherche importante (1 PU-PH, 1 PU et 1 MCU-PH) comprenant le développement et l’utilisation de nouvelles techniques de pointe (séquençage long read, analyse d’exome, profilage transcriptomique et protéomique,…).
Le LBM recherche un Bioinformaticien H/F en CDD dès à présent pour une durée de 12 mois.
VOS MISSIONS :
Au sein des 2 unités :
Paramétrage et validation d’un pipeline pour NGS tumoral ADN/ARN
Développement et validation d’un pipeline pour l’analyse long read ADN et ARN
Configuration du nouveau serveur de calcul
Sélection et traitement des données des bases UK Biobank & AllOfUs
Analyse de données de transcriptomique et de protéomique
Analyse biostatistique des données clinico-pathologiques
VOTRE PROFIL :
Master 2 de Bioinformatique avec compétence en biostatistique,
Intégrer les dimensions éthiques, juridiques et déontologiques dans sa pratique professionnelle,
Respect du secret médical, Intérêt pour la recherche.
Type d'emploi : Temps plein, CDD, CDI
Rémunération : 28 971,00€ à 31 808,00€ par an
Avantages :
Lieu du poste : En présentiel
