Le candidat (H/F) aura pour mission principale, sous la responsabilité d’un chercheur d'Edytem (Yves PERRETTE) de réaliser le traitement des données de séquençage 16S pour du métabarcoding obtenues dans le cadre du projet Biokarst financé par l'agence de l'eau Rhône Méditerranée Corse.
Plus spécifiquement, les missions de l’agent seront l'analyse des données déjà acquises et leur valorisation sous forme de publications scientifiques ;
- Réaliser les traitement bioinformatiques
- Analyser et présenter les résultats aux membres du projet Biokarst
- Diffuser et valoriser les données sous forme de rapports techniques et de publications scientifiques
Savoirs généraux, théoriques ou disciplinaires :
- Connaissances des microbiomes associés au milieu souterrain karstique
- Connaissances des méthodologies de bio informatique pour le traitement des données issues de séquençage 16S pour du métabarcoding
- Outils informatiques (traitement de texte, tableur, R)
- Langue anglaise : B1 à B2 selon le cadre européen commun de référence pour les langues
Savoir-faire opérationnels :
- Interagir avec les biologistes du laboratoire
- Interagir avec des partenaires non académiques
- Assurer une veille scientifique
- Travailler avec méthode et rigueur
- Transmettre des connaissances
- Garantir la qualité et la pertinence des outils d'analyse et des résultats
- Appliquer les règles d’hygiène et de sécurité
Ce projet est financé dans le cadre du projet Biokarst financé par la zone atelier bassin du rhône et l'agence de l'eau Rhône Mediterranée Corse. La ou le candidat sera encadré par Yves PERRETTE (Edytem) et Florian MERMILLOD-BLONDIN chercheur au Laboratoire d'Ecologie des Hydrosystèmes Naturels et Anthropisés de Lyon.
Le Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS) est un organisme public de recherche français dont les laboratoires (et les chercheurs, ingénieurs et personnels de soutien) sont répartis sur tout le territoire. L’ingénieur(e) de recherche sera intégré(e) à l’équipe de recherche « Zone Critique » de l’unité EDYTEM (« Environnements, Dynamiques et Territoires de Montagne » ; Le Bourget-du-Lac, France) ainsi qu'au pôle d'analyses. L'activité se déroulera sur deux sites : à EDYTEM (Le Bourget du Lac) et au LEHNA (Lyon).
L’unité de recherche EDYTEM fait partie de l’Université Savoie Mont-Blanc (USMB), l’une des principales institutions académiques de la région Auvergne-Rhône-Alpes. Le campus du Bourget-du-Lac, où est située EDYTEM, est idéalement placé pour les activités de plein air, à proximité du lac du Bourget, entre Chambéry et Aix-les-Bains. Il offre une large gamme d’activités sportives, de loisirs et d’événements culturels proposés par l’université.
Sans contraintes et risques particuliers.
entre 3143€ et 4541,08 € bruts mensuels selon l'expérience
44 jours
Pratique et indemnisation du TT
Prise en charge à 75% du coût et forfait mobilité durable jusqu’à 300€
Référence de l’offre
UMR5204-YVEPER0-008
Secteur d’activité
Sciences du vivant, de la terre et de l'environnement
Emploi type
Ingenieur biologiste en analyse de donnees (H/F)
Le CNRS est un acteur majeur de la recherche fondamentale à une échelle mondiale. Le CNRS est le seul organisme français actif dans tous les domaines scientifiques. Sa position unique de multi-spécialiste lui permet d’associer les différentes disciplines pour affronter les défis les plus importants du monde contemporain, en lien avec les acteurs du changement.
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